肺囊肿不可以自愈。肺囊肿不会自己消失。肺囊肿比较严重，尤其是出现了胸闷咳嗽或者是唿吸困难，这时候应该要有引起重视，可以通过手术的方式来进行治疗。
肺囊肿是肺内含有大小不等的气体或既有气体又有液体的囊性病变，主要由先天肺泡发育不全所导致，与胚胎发育时期唿吸系统的气管、支气管异常萌芽密切相关，也可能是由于后天继发感染或非感染因素导致肺泡过度膨胀而出现的肺囊肿。肺囊肿属于良性病变，单发孤立的肺囊肿如果体积较小，通常对肺功能影响不大，一般不会产生各种不良反应，所以暂时不需要特殊处理，需遵医嘱定期复查。
大多数的肺囊肿不会自己消失，除非是单一的肺囊肿破裂气体外溢，这种情况下孤立的肺囊肿可能会自己消失。对于先天性的肺囊肿，如果体积较小，可以不用治疗，但如果体积较大或出现感染等情况，则需要通过手术等方法治疗。对于后天性的肺囊肿，需要根据病情进行治疗，包括抗感染治疗、引流治疗等。